“警报，有不明生物体入侵！”几首遭遇自杀袭击的母舰自检系统发出警报。原来是吞噬虫通过撞击母舰，贴在母舰上，利用自身腐蚀性酸液溶解了舰体，并入侵进来。
“命令舰队卫兵立即击杀入侵的吞噬虫！”高能机器人亚瑟十分担心，他见过吞噬虫的威力，对遭遇吞噬虫入侵的母舰命运担忧。在正面战场上，虽然仍旧有较多的小型飞碟和吞噬虫游走在空间，但敌方母舰已经全军覆没，伏击战取得了初步胜利。
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亚瑟命令未遭遇吞噬虫入侵的母舰立即撤离，而他所在的核动力宇宙飞船长江号指挥舰则继续留下战斗。长江号能量护盾厚实，即使不断遭遇吞噬虫以及小型飞碟的撞击仍旧丝毫无损。但对于几首遭遇吞噬虫入侵的母舰，长江号束手无策。通讯系统显示，几艘被入侵的母舰已经开始失控。吞噬虫的入侵，感染了舰队人员，造成母舰部分瘫痪。
“舰队非战斗人员，立即撤离到长江号，立即撤离到长江号！”亚瑟担心舰队人员全部感染，下令弃舰保人。几首母舰操控人员立即建立与长江号的瞬时传送通道，并开始向长江号传送人员和物质。
突然，长江号遭遇不明物体的猛烈撞击，各传送通道均关闭。待亚瑟们查明情况，原来一只悬浮在太空的巨型吞噬虫正用触手不断抽打长江号，令所有传送中断。这只巨型吞噬虫不断卷走星际空间中的舰艇碎片和敌我双方的小型飞船，体积还在继续膨胀。
“击杀这只吞噬虫！”亚瑟命令道。然而母舰在空中的行动十分缓慢，而吞噬虫的动作迅速，长江号的攻击往往失准。此时，几首被入侵的银河舰队母舰也调转舰头，朝长江号开始攻击。显然，吞噬虫已经完全控制了入侵的母舰。
形势的突转直下，令亚瑟大感不妙。为了保存现有力量，亚瑟当机力断：击毁剩下的母舰。于是长江号朝几首母舰开火，这些母舰缺乏有效控制，纷纷中弹爆炸。但剩下的一首却被漂浮在空中的吞噬虫夺走，并成功逃脱。高能机器人亚瑟不得不命令收兵，并向总部报告战况。
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经过两场战斗，双方均损失惨重，虽然几乎消灭了吞噬虫在ZST-339的有生力量，但银河系军团的地面基地也被摧毁。银河系为了保存战果，决定坚守同步轨道的空中基地，防止敌方再次入侵ZST-339。至于如何对付超巨型吞噬虫，只能寄希望于新武器的开发。
在红玫瑰的能量基地，恒星能量站已经顺利启动，这为快速补充战斗力提供了基础，同时，一项秘密的计划也正在实施中。但是，基地内部出现的间谍事件为基地的运转蒙上了阴影。
拉姆勒派遣了灵猫族的尤中尉和李少尉两人来协助红玫瑰调查间谍案，但由于线索中断，调查毫无进展。针对吞噬虫母星的监视情报显示，星球上更为庞大的军队的集结已经开始，新的战斗必将开始。